70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2713 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  89.18 
 
 		 414 aa  759    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  89.4 
 
 		 415 aa  766    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  87.23 
 
 		 415 aa  734    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  99.04 
 
 		 415 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  90.12 
 
 		 415 aa  771    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  90.12 
 
 		 415 aa  772    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 415 aa  845    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  79.04 
 
 		 415 aa  679    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  98.8 
 
 		 415 aa  837    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  75.18 
 
 		 415 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  96.14 
 
 		 414 aa  812    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  70.84 
 
 		 415 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  69.88 
 
 		 415 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  70.95 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  70.63 
 
 		 419 aa  594  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  70.26 
 
 		 416 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  42.04 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  40.57 
 
 		 419 aa  302  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  40.48 
 
 		 423 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  29.79 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  30.05 
 
 		 390 aa  140  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  29.88 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  24.75 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  24.32 
 
 		 404 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  28 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  23.71 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  26.35 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  23.85 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  26.21 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 428 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  21.28 
 
 		 510 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  21.47 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  23.44 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  24.44 
 
 		 365 aa  57  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 3172 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  24.44 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  24.2 
 
 		 1040 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  31.65 
 
 		 223 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.89 
 
 		 573 aa  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  24.2 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  18.47 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 		 3301 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 214 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 602 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 465 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2819  hypothetical protein  27.88 
 
 		 471 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70664  hitchhiker  0.00000273831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.13 
 
 		 810 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 878 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  21.1 
 
 		 992 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 883 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1297 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.3 
 
 		 2240 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 4489 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.67 
 
 		 758 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 621 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 		 201 aa  43.9  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  22.1 
 
 		 388 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  22.1 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  22.1 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2153  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.569131  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 366 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 258 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 562 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.77 
 
 		 364 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0567  hypothetical protein  40 
 
 		 534 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>