50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1065 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 447 aa  918    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  59.9 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  43.14 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  31.12 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  26.18 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  26.15 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 419 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  24.67 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  24.88 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 415 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  24.88 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  27.08 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  24 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  24.6 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  23.71 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  24.42 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  24.86 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  24.3 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  25.06 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  23.39 
 
 		 416 aa  96.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 414 aa  96.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  22.78 
 
 		 492 aa  90.5  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  21.89 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  25.31 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  24.13 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  22.4 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  22.14 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  23.14 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  21.43 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  21.77 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  21.61 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  21.61 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  21.61 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  23.08 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  20.16 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  21.93 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 		 804 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  24.15 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  25.36 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  22.89 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.66 
 
 		 784 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  31.39 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>