69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0611 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 428 aa  859    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  29.59 
 
 		 407 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  29.8 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  31.54 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  26.56 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  26.91 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  25.5 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  26.84 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  27.88 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  24.2 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  25.65 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  25.64 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 415 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  23.49 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  24.4 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 414 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  27.07 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  25.16 
 
 		 415 aa  97.1  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  26.19 
 
 		 452 aa  96.7  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  23.33 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  22.49 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  23.57 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  23.3 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  25.87 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  25.37 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  25.2 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  27.7 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  23.38 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2157  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.757147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  22.73 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  25.23 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  20.95 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  24.37 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.91 
 
 		 573 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1652  Tetratricopeptide TPR_4  26.88 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  21.69 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  21.69 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0844  hypothetical protein  24.76 
 
 		 744 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0481694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  22.05 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1276 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 		 320 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 750 aa  50.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  23.61 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1121 aa  49.7  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 833 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  26.53 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.9 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 722 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 591 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 602 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.54 
 
 		 1694 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.19 
 
 		 566 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1021  phosphotransferase domain-containing protein  28.83 
 
 		 334 aa  43.9  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.44555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  19.9 
 
 		 573 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.95 
 
 		 758 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>