183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1021 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1021  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  670    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.44555  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
927 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.17 
 
 
1694 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 
543 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.41 
 
 
436 aa  76.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.94 
 
 
784 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
4079 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
465 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.36 
 
 
573 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
3172 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
602 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
1276 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.87 
 
 
810 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.07 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.41 
 
 
626 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
878 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.15 
 
 
1138 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25.23 
 
 
1013 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
589 aa  63.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
4489 aa  63.5  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 
711 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.25 
 
 
620 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.17 
 
 
730 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.83 
 
 
626 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
1737 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
614 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
409 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
366 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1094 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
634 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  24.48 
 
 
626 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
614 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
620 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 
486 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  24.48 
 
 
614 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  24.48 
 
 
614 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
615 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.35 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.96 
 
 
887 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
375 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
1486 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
562 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  38.89 
 
 
1101 aa  56.2  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.36 
 
 
1979 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
612 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 
632 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
750 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
1069 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 
220 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
564 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  21.9 
 
 
955 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 
636 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  34.07 
 
 
576 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
3301 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
639 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.03 
 
 
587 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
635 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
635 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
356 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  33.33 
 
 
545 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
402 aa  52.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
409 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.43 
 
 
465 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
718 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.97 
 
 
833 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  26.67 
 
 
791 aa  51.6  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
611 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
3035 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  23.81 
 
 
682 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 
3560 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.15 
 
 
1056 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
505 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  20.54 
 
 
643 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.86 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
448 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.26 
 
 
707 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.75 
 
 
565 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 
758 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 
1459 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.54 
 
 
676 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
955 aa  49.7  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
637 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  21.72 
 
 
1600 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 
208 aa  49.7  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
466 aa  49.7  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  21.4 
 
 
467 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.26 
 
 
635 aa  49.3  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  23.18 
 
 
623 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 
1073 aa  49.3  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
448 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
505 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  25.38 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.15 
 
 
545 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>