More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2046 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  61.14 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.53 
 
 		 199 aa  207  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.69 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.74 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0333  TPR repeat-containing protein  48.21 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000188305  normal  0.0509123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  42.63 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 878 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.31 
 
 		 810 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.2 
 
 		 887 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  34.43 
 
 		 622 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 1737 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.8 
 
 		 1694 aa  68.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.22 
 
 		 587 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  31.62 
 
 		 545 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 909 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 927 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 1192 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  65.9  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 637 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 1276 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 1486 aa  65.5  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.37 
 
 		 725 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.27 
 
 		 743 aa  65.1  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 681 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 646 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 649 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 649 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.83 
 
 		 875 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 968 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.79 
 
 		 764 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 3035 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.66 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 4079 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 620 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 718 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 		 714 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.33 
 
 		 397 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 620 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 471 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.71 
 
 		 626 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 		 4489 aa  61.6  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.95 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  32.26 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.49 
 
 		 632 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  30.89 
 
 		 1154 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 707 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.77 
 
 		 2240 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1038 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  29.7 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 635 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 635 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  27.1 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.31 
 
 		 503 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 714 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 715 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.03 
 
 		 836 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  29.58 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 366 aa  58.9  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  25.75 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 		 626 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  35.14 
 
 		 417 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 		 614 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.58 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 614 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 		 614 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  32.73 
 
 		 566 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.96 
 
 		 626 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 503 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 864 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 716 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1049 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>