More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0693 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  85.08 
 
 
393 aa  660    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  81.98 
 
 
393 aa  659    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
395 aa  800    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  47.92 
 
 
402 aa  362  6e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.16 
 
 
1694 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
1276 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
543 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
562 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.56 
 
 
576 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.03 
 
 
573 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
927 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
602 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
955 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.2 
 
 
730 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
784 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
4079 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
711 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.71 
 
 
707 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.02 
 
 
1979 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24.33 
 
 
635 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
878 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.4 
 
 
810 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
740 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.85 
 
 
1138 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
1069 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
4489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.32 
 
 
292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 
632 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.54 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
366 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 
1056 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 
1049 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
617 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
414 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3035 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.17 
 
 
1007 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.06 
 
 
1056 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.36 
 
 
564 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 
1737 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1297 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 
758 aa  106  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.29 
 
 
560 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
591 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 
1013 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
3172 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
329 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
3560 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.33 
 
 
745 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
589 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.61 
 
 
2240 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
605 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
1094 aa  99.8  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
279 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
935 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  23.42 
 
 
519 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.92 
 
 
1056 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.65 
 
 
436 aa  96.7  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
448 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.75 
 
 
1067 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 
465 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  26.24 
 
 
623 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 
465 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 
1022 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  20.11 
 
 
747 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
512 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.52 
 
 
676 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
1276 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 
1827 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
1421 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  21.53 
 
 
626 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
221 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.11 
 
 
818 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
828 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
1486 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  24.22 
 
 
369 aa  89  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.12 
 
 
296 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.1 
 
 
1676 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  20.86 
 
 
828 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
761 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 
466 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  23.87 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  26.32 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 
597 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 
833 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  26.11 
 
 
815 aa  87  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  20.6 
 
 
643 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  21.43 
 
 
620 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
828 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.74 
 
 
732 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.81 
 
 
466 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.96 
 
 
733 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
409 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>