More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6872 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1459 aa  2828    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 878 aa  98.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 4079 aa  95.9  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 2240 aa  91.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.33 
 
 		 1694 aa  87.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 632 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.12 
 
 		 810 aa  83.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1276 aa  78.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3145 aa  76.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.62 
 
 		 1486 aa  75.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.19 
 
 		 1056 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 615 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.67 
 
 		 648 aa  73.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.19 
 
 		 725 aa  73.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.53 
 
 		 486 aa  73.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.18 
 
 		 707 aa  70.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 		 1737 aa  70.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.39 
 
 		 2401 aa  69.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.18 
 
 		 689 aa  68.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1138 aa  68.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 884 aa  68.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.97 
 
 		 397 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 883 aa  67.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.09 
 
 		 620 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 		 395 aa  67  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 		 750 aa  67  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1161 aa  66.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1069 aa  65.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.72 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.16 
 
 		 733 aa  64.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.16 
 
 		 626 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 620 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  22.93 
 
 		 321 aa  65.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.89 
 
 		 573 aa  64.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 639 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.55 
 
 		 1067 aa  63.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.09 
 
 		 3301 aa  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 597 aa  64.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.02 
 
 		 884 aa  63.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 909 aa  63.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.14 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.3 
 
 		 1050 aa  62.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 847 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  20.34 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.68 
 
 		 1979 aa  62.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0993  putative lipoprotein  29.28 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0358933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  24.62 
 
 		 614 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  24.62 
 
 		 614 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  24.62 
 
 		 626 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 433 aa  61.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 		 639 aa  61.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 614 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 544 aa  61.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.15 
 
 		 863 aa  61.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 602 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.62 
 
 		 626 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1676 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.82 
 
 		 1056 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  28.04 
 
 		 937 aa  60.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 601 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.28 
 
 		 676 aa  60.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 311 aa  60.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 767 aa  60.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  22.56 
 
 		 979 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 573 aa  60.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  21.11 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.52 
 
 		 882 aa  59.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.19 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.92 
 
 		 887 aa  59.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 3560 aa  59.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  21.62 
 
 		 992 aa  59.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  19.62 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.62 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 864 aa  58.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  21.51 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 808 aa  58.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.77 
 
 		 340 aa  58.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 465 aa  58.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 332 aa  58.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.81 
 
 		 988 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 635 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 260 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 		 261 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 711 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 635 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1406 aa  58.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.98 
 
 		 561 aa  57  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  23.95 
 
 		 929 aa  56.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 634 aa  56.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>