More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0993 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0993  putative lipoprotein  100 
 
 		 477 aa  971    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0358933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.19 
 
 		 810 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 878 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1676 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.85 
 
 		 1979 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 927 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 		 632 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 1094 aa  73.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 747 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 4489 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.26 
 
 		 988 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.74 
 
 		 837 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 740 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  28.87 
 
 		 715 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 1276 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.71 
 
 		 864 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.39 
 
 		 1056 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 685 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 4079 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.15 
 
 		 875 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.26 
 
 		 818 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.27 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.69 
 
 		 1022 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 3560 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 634 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1069 aa  67.8  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 612 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.82 
 
 		 784 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.81 
 
 		 594 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 648 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.39 
 
 		 865 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 804 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 681 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 955 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  23.89 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.99 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 3035 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 		 1486 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  30.87 
 
 		 1013 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 860 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.31 
 
 		 1694 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.14 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 2262 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 1421 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 935 aa  64.3  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.86 
 
 		 884 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 713 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.42 
 
 		 816 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.57 
 
 		 2401 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.38 
 
 		 882 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.46 
 
 		 882 aa  63.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  27.44 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 909 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 699 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  24.14 
 
 		 623 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26.54 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 217 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.89 
 
 		 795 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.76 
 
 		 267 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.85 
 
 		 739 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.57 
 
 		 936 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.28 
 
 		 1459 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.91 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.23 
 
 		 1056 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.62 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 2262 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 827 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.25 
 
 		 784 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  24.44 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  26.42 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 847 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 627 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>