More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0687 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 2262 aa  4379    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  78.3 
 
 		 2262 aa  3163    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.44 
 
 		 2240 aa  552  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1676 aa  242  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 4079 aa  239  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.5 
 
 		 1694 aa  210  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 878 aa  187  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.91 
 
 		 810 aa  166  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 1737 aa  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.28 
 
 		 887 aa  145  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.04 
 
 		 927 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 3172 aa  140  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 1069 aa  139  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 909 aa  134  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 685 aa  134  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.39 
 
 		 1979 aa  130  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.14 
 
 		 725 aa  126  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 1421 aa  126  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 681 aa  126  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 		 1056 aa  124  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.67 
 
 		 816 aa  122  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.91 
 
 		 1486 aa  120  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 847 aa  119  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1276 aa  119  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  18.9 
 
 		 2059 aa  119  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 828 aa  118  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 3145 aa  118  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 486 aa  117  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 828 aa  117  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.04 
 
 		 1022 aa  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 		 632 aa  116  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.47 
 
 		 1056 aa  116  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 362 aa  116  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.87 
 
 		 626 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  19.83 
 
 		 1297 aa  114  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.87 
 
 		 626 aa  113  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 614 aa  113  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.38 
 
 		 620 aa  113  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 3301 aa  113  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 620 aa  112  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 566 aa  112  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 637 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 		 614 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 614 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 		 614 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 		 626 aa  110  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.12 
 
 		 936 aa  110  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 614 aa  109  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  21.9 
 
 		 1213 aa  109  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.27 
 
 		 1154 aa  109  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 754 aa  108  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.84 
 
 		 733 aa  108  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.29 
 
 		 784 aa  106  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 615 aa  106  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 612 aa  106  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.44 
 
 		 795 aa  105  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 636 aa  105  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 562 aa  104  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.84 
 
 		 1067 aa  104  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.37 
 
 		 639 aa  104  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 448 aa  104  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 708 aa  103  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.47 
 
 		 764 aa  103  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.56 
 
 		 865 aa  103  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 3035 aa  103  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 789 aa  102  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  20.53 
 
 		 1049 aa  102  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 465 aa  102  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.08 
 
 		 988 aa  102  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.35 
 
 		 837 aa  101  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 808 aa  101  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.5 
 
 		 603 aa  101  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 612 aa  100  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.09 
 
 		 622 aa  100  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 543 aa  100  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 637 aa  100  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  22.58 
 
 		 643 aa  99.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 828 aa  99.4  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 583 aa  99  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 1406 aa  99  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 754 aa  98.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 739 aa  98.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.74 
 
 		 576 aa  98.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.87 
 
 		 594 aa  98.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 639 aa  98.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.89 
 
 		 750 aa  97.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 611 aa  97.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.44 
 
 		 818 aa  97.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 750 aa  96.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  36.36 
 
 		 703 aa  96.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.99 
 
 		 955 aa  96.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 505 aa  96.3  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 597 aa  96.3  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.77 
 
 		 732 aa  95.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.69 
 
 		 573 aa  95.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 634 aa  95.5  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.01 
 
 		 689 aa  95.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  19.35 
 
 		 1056 aa  95.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 673 aa  95.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.64 
 
 		 614 aa  95.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>