52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03477 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  100 
 
 		 397 aa  783    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  73.42 
 
 		 395 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  69.35 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  68.84 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  27.3 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  24.85 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  24.5 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  23.14 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  21.96 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  23.28 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  23.91 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  24.73 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  22.96 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  21.08 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  20.1 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  21.89 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  22.6 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 1297 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.64 
 
 		 810 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  22.61 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  21.68 
 
 		 419 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 289 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 934 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  23.45 
 
 		 454 aa  49.7  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.11 
 
 		 631 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  32.23 
 
 		 1006 aa  47  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.37 
 
 		 661 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 562 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1065  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 449 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33 
 
 		 784 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  31.33 
 
 		 579 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.89 
 
 		 1694 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0228  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32958  hitchhiker  0.0059641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0233  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00046465  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 162 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  24.71 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 209 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.12 
 
 		 576 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  29.7 
 
 		 939 aa  43.5  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 860 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 543 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>