40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0357 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 446 aa  912    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  31.12 
 
 		 447 aa  199  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  30.9 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  27.1 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  28.24 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  29.75 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  28.05 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  27.58 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 414 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  26.21 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  24.28 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  28.38 
 
 		 415 aa  93.2  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  25.68 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  26.51 
 
 		 415 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  28.67 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  26.1 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  25 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  23.86 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  23.05 
 
 		 510 aa  67  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  22.83 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  23.26 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  23.26 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  22.84 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  23.77 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  23.26 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  23.43 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  22.6 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  21.78 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  22.14 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 1297 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>