16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1444 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  95.43 
 
 		 394 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  795    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  69.04 
 
 		 396 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  70.3 
 
 		 396 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  70.3 
 
 		 396 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  71.99 
 
 		 388 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  63.3 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  40.53 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  38.9 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0811  hypothetical protein  26.03 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1289  tetratricopeptide TPR_2  25.87 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  22.14 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  23.1 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4566  hypothetical protein  28.45 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1919  hypothetical protein  24.94 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0683862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>