14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0385 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  799    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  64.5 
 
 
394 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  62.25 
 
 
396 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  63.45 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  63.45 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  64.1 
 
 
388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  63.69 
 
 
394 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  40.05 
 
 
406 aa  235  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  37.47 
 
 
415 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1289  tetratricopeptide TPR_2  32.28 
 
 
426 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0811  hypothetical protein  29.06 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4566  hypothetical protein  27.88 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  22.79 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>