17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2996 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  794    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  95.43 
 
 		 394 aa  738    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  69.29 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  70.81 
 
 		 396 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  70.81 
 
 		 396 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  71.99 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  62.77 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  39.9 
 
 		 406 aa  282  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  39.36 
 
 		 415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0811  hypothetical protein  25.96 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1289  tetratricopeptide TPR_2  26.88 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  22.11 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4566  hypothetical protein  27.54 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  22.11 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1919  hypothetical protein  24.69 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0683862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  22.19 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  21.64 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>