12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4566 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4566  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  832    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1289  tetratricopeptide TPR_2  34.01 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1919  hypothetical protein  30.73 
 
 		 433 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0683862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  28.31 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  26.68 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  27.88 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  25.54 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  27.51 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  27.04 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  27.04 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  27.12 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  25.48 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>