16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2091 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  826    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  40.27 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  40.43 
 
 
396 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  39.95 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  39.69 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  39.69 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2996  hypothetical protein  40.8 
 
 
394 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719051  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0385  hypothetical protein  37.83 
 
 
402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  33.69 
 
 
406 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1289  tetratricopeptide TPR_2  25.45 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  21.3 
 
 
447 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0811  hypothetical protein  23.94 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  23.42 
 
 
441 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4566  hypothetical protein  27.17 
 
 
423 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  21.36 
 
 
454 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  21.47 
 
 
452 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>