47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03430 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  100 
 
 		 441 aa  900    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  56.69 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  38.3 
 
 		 454 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  30.9 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  27.46 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  26.76 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  27.7 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  25.53 
 
 		 431 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  25.82 
 
 		 510 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  26.04 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  25.43 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  25.58 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  25.69 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  27.45 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  26.04 
 
 		 415 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  25.12 
 
 		 419 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 414 aa  97.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  23.89 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  26.51 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  24.53 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  21.53 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  25.68 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  23.25 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  24.93 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5004  hypothetical protein  22.28 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  23.53 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  23.16 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2091  hypothetical protein  23.76 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.030072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1728  hypothetical protein  22.81 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411446  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6365  hypothetical protein  22.26 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0654356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1713  hypothetical protein  22.26 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  22.45 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1444  hypothetical protein  21.66 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1620  hypothetical protein  20.62 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.583527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  23.1 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3231  hypothetical protein  20.31 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 245 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>