34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1149 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  778    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  54.85 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  52.04 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  51.41 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  27.22 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  28.67 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  27.42 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  26.94 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  26.96 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  25.41 
 
 		 431 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  25 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  26.6 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  25.4 
 
 		 423 aa  96.3  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  28.23 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  25.93 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  27 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  23.68 
 
 		 407 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  25.95 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  23.75 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  25.6 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  20 
 
 		 492 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  26.59 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  21.22 
 
 		 510 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  21.43 
 
 		 446 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.52 
 
 		 784 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>