46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2420 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  76.14 
 
 		 415 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  75.18 
 
 		 415 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  75.18 
 
 		 415 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  75.18 
 
 		 415 aa  654    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  79.76 
 
 		 415 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  100 
 
 		 415 aa  843    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  75.42 
 
 		 414 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  74.7 
 
 		 415 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  74.94 
 
 		 415 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  73.56 
 
 		 414 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  74.46 
 
 		 415 aa  630  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  71.36 
 
 		 419 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  72.88 
 
 		 419 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  70.84 
 
 		 415 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  70.84 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  68.16 
 
 		 416 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  41.61 
 
 		 419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  39.95 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  40.44 
 
 		 423 aa  296  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  29.4 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  27.89 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  27.68 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  26.82 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  26.81 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  28.24 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  25.06 
 
 		 447 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  25.57 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  23.45 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  25.48 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  21.91 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0875  hypothetical protein  21.83 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  23.64 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  32.91 
 
 		 223 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  24.34 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.92 
 
 		 833 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  21.99 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 208 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  22.02 
 
 		 992 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 602 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 258 aa  43.9  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>