36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06755 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06755  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  784    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  81.79 
 
 		 390 aa  660    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1149  hypothetical protein  53.7 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0116  hypothetical protein  52.31 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  30.05 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  28.53 
 
 		 415 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  30.67 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  28.53 
 
 		 415 aa  126  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  27.84 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  28.75 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  27.68 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  28 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  27.48 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  25.07 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  27.3 
 
 		 416 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  24.36 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  23.29 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  22.4 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  24.6 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3867  hypothetical protein  23.93 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  22.14 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 		 784 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 1737 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 3035 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.22 
 
 		 676 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  35.06 
 
 		 223 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 2240 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>