211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3146 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  100 
 
 
223 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  38.61 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  40.51 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  44.87 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  44.3 
 
 
206 aa  79  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  39.29 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  39.29 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  39.29 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  39.29 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  39.24 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  41.03 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  38.1 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  38.1 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  35.64 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  37.35 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  40.48 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  39.24 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  36.9 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  36.9 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  41.03 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  36.9 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  41.03 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  41.03 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  41.03 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  43.59 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  41.03 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  36.9 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  40.51 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  35.71 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  37.97 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  34.52 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  41.03 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  51.79 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  36.59 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  37.97 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  35.44 
 
 
458 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  40.26 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  34.51 
 
 
93 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  38.16 
 
 
370 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  37.18 
 
 
369 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  42.86 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  44.64 
 
 
405 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  32.95 
 
 
368 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  40.68 
 
 
403 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  37.18 
 
 
256 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  37.18 
 
 
252 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  37.18 
 
 
256 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  35.9 
 
 
370 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  31.65 
 
 
205 aa  61.6  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  45.45 
 
 
390 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  40 
 
 
373 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  34.21 
 
 
369 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  30.59 
 
 
392 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  33.33 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  42.86 
 
 
397 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  34.18 
 
 
349 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  33.33 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  44.64 
 
 
249 aa  58.9  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  35.53 
 
 
370 aa  58.5  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  42.86 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  35 
 
 
367 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  42.86 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2868  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  26.8 
 
 
391 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  34.44 
 
 
152 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  32.91 
 
 
415 aa  55.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  32.97 
 
 
467 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  35.82 
 
 
404 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3888  TonB family protein  31.4 
 
 
147 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  35.71 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  35.9 
 
 
242 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  35.9 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  35.9 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  31.82 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
415 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
415 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  35.9 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  31.4 
 
 
115 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
415 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  29.49 
 
 
361 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  35.9 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  31.65 
 
 
415 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  37.5 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  32.91 
 
 
415 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  34.67 
 
 
342 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  42.17 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  32.05 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  35.71 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  35.71 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  37.5 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  35.14 
 
 
305 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  30.38 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  35.71 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  40 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  35.71 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  35.71 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  35.71 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  33.33 
 
 
371 aa  52.4  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  35.71 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  35.71 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>