249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0610 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  100 
 
 		 217 aa  430  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  36.49 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  36.28 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  34.55 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  32.73 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  32.42 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  32.57 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  32.42 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  33.79 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  33.79 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  33.8 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  32.88 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  32.88 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  31.51 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  31.96 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  33.33 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  29.33 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  32.42 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  33.79 
 
 		 207 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  29.63 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  30.73 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  30.14 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  33.02 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  28.25 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  32.55 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  30.41 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  30.48 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  30.09 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  30 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  27.52 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.21 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  35.65 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  29.91 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  31.02 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  29.91 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  29.03 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  30.48 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  44.83 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  28.1 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  44.3 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  36.79 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  44.87 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  39.77 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  38.61 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  41.98 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  30.18 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  37.74 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  39.53 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  41.67 
 
 		 367 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  36.47 
 
 		 277 aa  72  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  40.51 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  39.51 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  39.81 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  35.48 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  29.28 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  41.67 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  31.97 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  36.78 
 
 		 467 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  35.71 
 
 		 368 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  43.55 
 
 		 417 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  34.12 
 
 		 361 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  34.48 
 
 		 371 aa  65.1  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  38.1 
 
 		 392 aa  65.1  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.96 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  40.62 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  37.18 
 
 		 110 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  34.15 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  40.26 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  37.5 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  37.84 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  28.7 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  30.16 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  38.82 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  30.12 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  30.59 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  33.33 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  41.03 
 
 		 565 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  29.58 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  39.02 
 
 		 700 aa  62  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  29.41 
 
 		 370 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  27.71 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  31.4 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  35.06 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  32.5 
 
 		 582 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  38.89 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  33.33 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  33.33 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  32.43 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  40.3 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  25.88 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  35 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  33.33 
 
 		 371 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  32.31 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  32.39 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  38.46 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  35.71 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  37.1 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  28.57 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  32.43 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  31.71 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>