189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1444 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  98.65 
 
 		 371 aa  741    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  100 
 
 		 371 aa  751    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  72.62 
 
 		 334 aa  136  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  67.47 
 
 		 340 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  37.17 
 
 		 203 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  38.18 
 
 		 203 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  32.54 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  44.44 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  46.03 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  46.03 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  44.44 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  48.48 
 
 		 237 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  48.44 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  29.31 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  37.8 
 
 		 115 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.81 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  44.29 
 
 		 110 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  38.46 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  38.46 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  38.46 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  50.88 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  50.88 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  31.62 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  43.59 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  34.92 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  44.19 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  36.51 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  46.03 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  29.41 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  38.1 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  32.32 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  41.27 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  42.11 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  28.57 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  38.1 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  38.1 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  36.51 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.51 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  37.5 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  33.68 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  41.07 
 
 		 184 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  44.44 
 
 		 202 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  38.1 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  39.68 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.51 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  29.41 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  36.51 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  45.45 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  32.35 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  38.1 
 
 		 131 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  38.1 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  38.1 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  34.33 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  28.95 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  36.51 
 
 		 207 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  43.84 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  31.62 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  30.3 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  30.12 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  36.51 
 
 		 206 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  36.51 
 
 		 207 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  35.21 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  31.62 
 
 		 231 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  30.85 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  36.84 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  35.21 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  35.21 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  35.21 
 
 		 244 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  35.21 
 
 		 239 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  35.21 
 
 		 244 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  34.92 
 
 		 207 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  35.21 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  34.92 
 
 		 207 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  35.21 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  35.48 
 
 		 417 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  35.21 
 
 		 243 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35.23 
 
 		 112 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  36.51 
 
 		 205 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  39.68 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  34.92 
 
 		 206 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  39.29 
 
 		 507 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  32.43 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  32.43 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0079  TonB family protein  39.71 
 
 		 148 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.416956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  33.78 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  31.13 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  31.65 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  33.33 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  37.93 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  33.33 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  31.61 
 
 		 259 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  41.79 
 
 		 236 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  36.36 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2868  hypothetical protein  31.94 
 
 		 148 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  38.1 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  36.76 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  43.55 
 
 		 227 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  31.75 
 
 		 367 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  36.92 
 
 		 251 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  36.11 
 
 		 260 aa  49.7  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>