175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2421 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  84.88 
 
 		 206 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  83.41 
 
 		 206 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  83.41 
 
 		 206 aa  317  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  83.41 
 
 		 206 aa  317  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  88.41 
 
 		 206 aa  317  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  83.5 
 
 		 207 aa  314  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  83.5 
 
 		 207 aa  313  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  83.5 
 
 		 207 aa  313  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  81.95 
 
 		 206 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  79.61 
 
 		 207 aa  309  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  78.74 
 
 		 206 aa  298  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  82.44 
 
 		 206 aa  294  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  81.16 
 
 		 206 aa  294  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  77.07 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  78.26 
 
 		 205 aa  289  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  59.41 
 
 		 203 aa  214  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  56.86 
 
 		 204 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  61.9 
 
 		 131 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  44.93 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  38.39 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  36.23 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  41.06 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  36.59 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  40.48 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  37.19 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  38.58 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  37.76 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  40 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  36.87 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  37.24 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  39.39 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  33.5 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.2 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  30.13 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  32.67 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  44.94 
 
 		 368 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  32.21 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  29.05 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  45.05 
 
 		 405 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  34.11 
 
 		 396 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  33.59 
 
 		 363 aa  85.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  40.66 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  45.24 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  40 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  46.51 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  40.7 
 
 		 370 aa  82  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  43.53 
 
 		 369 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  43.02 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  41.86 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  44.19 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  45.35 
 
 		 404 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  27.88 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  52.31 
 
 		 93 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  44.05 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  42.53 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  28.96 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  43.02 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  39.24 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  32.82 
 
 		 368 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  29.17 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  35.96 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  39.74 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  34.07 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.47 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.19 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  37.21 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  36.78 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  40.91 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  36.46 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  27.09 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  35.96 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  31.9 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  39.13 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  38.16 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  31.07 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  31.4 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  37.5 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  31.4 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  38.46 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  33.71 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  31.46 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  34.21 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  38.71 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  35.87 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  34.78 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  39.29 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  43.08 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  35.9 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  31.03 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  29.89 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  38.04 
 
 		 462 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  34.15 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  35.37 
 
 		 244 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  35.37 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0434  TonB-like protein  42.86 
 
 		 302 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  35.37 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  36.51 
 
 		 371 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  40.35 
 
 		 334 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  35.37 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>