130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4762 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  100 
 
 		 367 aa  753    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  34.88 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  34.77 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  32.31 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  34.67 
 
 		 368 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  36.44 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  33.95 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  34.67 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  34.75 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  33.95 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  33.69 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  33.6 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  33.42 
 
 		 369 aa  176  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  35.01 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  33.88 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  31.65 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  42.59 
 
 		 368 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  50 
 
 		 203 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  45.98 
 
 		 203 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  35.94 
 
 		 204 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  45.98 
 
 		 203 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  45.98 
 
 		 203 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  44.83 
 
 		 203 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  41.44 
 
 		 207 aa  86.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  46.07 
 
 		 203 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  44.83 
 
 		 203 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  39.34 
 
 		 206 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  45.05 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  45.98 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  40.54 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  36.8 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  41.98 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36 
 
 		 206 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  36 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  42.86 
 
 		 203 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  42.86 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  36.89 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.89 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  39.81 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  35.11 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  39.64 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  39.64 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  40.19 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  38.02 
 
 		 206 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  38.05 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  40 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  38.82 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  32.48 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  42.22 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  36.28 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  41.67 
 
 		 217 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  40 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  35.29 
 
 		 202 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  31.65 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.71 
 
 		 112 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  37.21 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  37.65 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  36.67 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  36.67 
 
 		 417 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  38.82 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  36.26 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  39.76 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  35 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  36.51 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  31.82 
 
 		 121 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  36 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  34.52 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  29.07 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  33.33 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.65 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.47 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.59 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  45.76 
 
 		 115 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  34.88 
 
 		 202 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  30.12 
 
 		 458 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  33.85 
 
 		 462 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  34.88 
 
 		 223 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  27.5 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  34.25 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  37.5 
 
 		 582 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.71 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  35.63 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  38.1 
 
 		 152 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  34.18 
 
 		 208 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  34.88 
 
 		 249 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  31.17 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  33.75 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  33.7 
 
 		 275 aa  50.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  33.33 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2868  hypothetical protein  30.43 
 
 		 148 aa  50.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  31.75 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  35.06 
 
 		 138 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  38.1 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  31.75 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.95 
 
 		 210 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  29.87 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  31.91 
 
 		 150 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  26.97 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  29.49 
 
 		 223 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>