98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1619 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  100 
 
 
260 aa  487  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  47.56 
 
 
115 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  32.79 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  28.74 
 
 
203 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  40.74 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  50 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  28.35 
 
 
203 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  46.03 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  46.67 
 
 
110 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  36.94 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  40.7 
 
 
203 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  39.53 
 
 
203 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  39.53 
 
 
203 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  31.94 
 
 
219 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  26.48 
 
 
203 aa  62.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  44.29 
 
 
206 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  37.5 
 
 
207 aa  62.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  46.43 
 
 
215 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  42.86 
 
 
223 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  31.78 
 
 
417 aa  62  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  44.62 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  43.94 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27.78 
 
 
405 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  41.1 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  37.88 
 
 
368 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  43.08 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  34.78 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  35.87 
 
 
207 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  37.93 
 
 
203 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  38.81 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  31.82 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  38.81 
 
 
206 aa  59.3  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  30.39 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.76 
 
 
206 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  37.31 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  37.31 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  35.25 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  31.85 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  37.31 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  37.31 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  37.23 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  41.18 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  37.31 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  26.32 
 
 
390 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  41.12 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  44.44 
 
 
340 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  39.71 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  32.32 
 
 
403 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  39.77 
 
 
205 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  39.68 
 
 
203 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  34.78 
 
 
367 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  26.77 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  34.13 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  42.37 
 
 
209 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  35.29 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  40 
 
 
131 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  35.37 
 
 
467 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  32.22 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  36.46 
 
 
202 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  45.61 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  33.33 
 
 
202 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  43.06 
 
 
334 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  28.43 
 
 
206 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  32.63 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  31.52 
 
 
397 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  30.43 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  29.29 
 
 
404 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0079  TonB family protein  42.25 
 
 
148 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.416956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  28.67 
 
 
314 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0271  TonB-like protein  22.85 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  36.11 
 
 
371 aa  49.3  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  32.91 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  37.08 
 
 
205 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  36.11 
 
 
371 aa  48.9  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  38.89 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 
361 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  32.58 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  39.68 
 
 
392 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  25.77 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  23.21 
 
 
3521 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  41.07 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.97 
 
 
2449 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  40.96 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  28.04 
 
 
443 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  34.88 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  28.08 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  38.71 
 
 
230 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  26.14 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  34.33 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  23.03 
 
 
3471 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  39.73 
 
 
319 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  23.03 
 
 
3472 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  37.93 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  36.99 
 
 
174 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  26.21 
 
 
231 aa  42.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  30.95 
 
 
252 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  36.92 
 
 
219 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  27.94 
 
 
269 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>