118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3111 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  100 
 
 
174 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  39.73 
 
 
246 aa  54.3  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  44.23 
 
 
239 aa  52  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  38.46 
 
 
268 aa  51.2  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  38.67 
 
 
289 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  38.67 
 
 
265 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  52 
 
 
246 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  52 
 
 
246 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  52 
 
 
248 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  52 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  52 
 
 
246 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  52 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  52 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  41.43 
 
 
441 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0623  TonB family protein  44.83 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.480841  normal  0.103893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  40 
 
 
507 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  42.11 
 
 
296 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  42.11 
 
 
237 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  43.94 
 
 
268 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  50 
 
 
244 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  31.34 
 
 
295 aa  48.5  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  46.43 
 
 
288 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  36.9 
 
 
250 aa  48.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  43.94 
 
 
268 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  48.21 
 
 
274 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  41.03 
 
 
270 aa  48.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  38.57 
 
 
300 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  48.21 
 
 
275 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  31.82 
 
 
286 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  31.46 
 
 
285 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  42.86 
 
 
443 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  46.43 
 
 
285 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  31.96 
 
 
235 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  48.21 
 
 
286 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  43.94 
 
 
268 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  47.06 
 
 
251 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  36.51 
 
 
323 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  36.76 
 
 
235 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  44.64 
 
 
287 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  39.62 
 
 
294 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  36.51 
 
 
323 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  44.26 
 
 
289 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  40.98 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  34.88 
 
 
296 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  40.98 
 
 
231 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  25.98 
 
 
274 aa  45.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  38.71 
 
 
316 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  44.23 
 
 
242 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  44.23 
 
 
242 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  41.67 
 
 
467 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  33.11 
 
 
284 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.1 
 
 
292 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  35.82 
 
 
281 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  39.34 
 
 
386 aa  44.7  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  44.64 
 
 
277 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  36.49 
 
 
260 aa  44.7  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  32.14 
 
 
288 aa  44.7  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  33.33 
 
 
227 aa  44.7  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  30.99 
 
 
282 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  36.92 
 
 
324 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  40 
 
 
226 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  44.64 
 
 
273 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  35.14 
 
 
317 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  38.6 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  34.18 
 
 
411 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  38.24 
 
 
278 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  44.64 
 
 
270 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.72 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  44.64 
 
 
264 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  37.14 
 
 
279 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  40 
 
 
244 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  39.29 
 
 
269 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  32.39 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  29.58 
 
 
282 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  38.18 
 
 
244 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  42 
 
 
274 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  44.64 
 
 
285 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  33.8 
 
 
297 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  40 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  40 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  44 
 
 
291 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  34.33 
 
 
281 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  44 
 
 
283 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  40 
 
 
256 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  40 
 
 
252 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  40 
 
 
256 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  40 
 
 
226 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  44.44 
 
 
225 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  25.4 
 
 
276 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  36.99 
 
 
115 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  38.18 
 
 
245 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  41.82 
 
 
245 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  43.48 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  38.89 
 
 
236 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  39.44 
 
 
117 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  48 
 
 
244 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>