191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1150 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  53.62 
 
 		 207 aa  231  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  53.4 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  49.51 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  54.37 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  38.21 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  37.2 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  36.89 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  37.68 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  37.68 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  38.16 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  35.05 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  35.05 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  35.98 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  36.23 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  36.23 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  35.75 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  35.89 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  36.23 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  36.23 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  33.65 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  34.43 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  34.3 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  53.85 
 
 		 131 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  32.99 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  31.98 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  32.49 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  32.49 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  32.51 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  33.81 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  32.02 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  31.98 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  28.17 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  28.44 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  31.43 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  28.84 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  45.05 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  29.57 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  28.37 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  44.3 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  38.82 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  41.67 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  24.19 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  26.92 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  37.36 
 
 		 363 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  28.5 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  34.07 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  38.64 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  35.96 
 
 		 396 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  38.46 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  33 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  36.67 
 
 		 371 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  36.67 
 
 		 371 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  35.48 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  26.97 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  36.78 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  35.11 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  35.58 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  42.86 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  35.79 
 
 		 371 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  34.04 
 
 		 370 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  37.5 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  35.63 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  30.23 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  34.57 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  34.34 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  38.71 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  38.71 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  38.71 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  35.29 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  32.94 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  30.48 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  31.18 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  32.98 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  32.22 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  36.71 
 
 		 373 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  36.11 
 
 		 467 aa  61.6  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  29.35 
 
 		 397 aa  61.2  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  36.36 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  35.71 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  35.71 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  32.69 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  35.71 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  35.71 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  35.71 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  29.94 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  33.7 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  43.75 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  35.29 
 
 		 458 aa  58.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  35.71 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  35.71 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  35.71 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  35.71 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  35.71 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  35.71 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  35.71 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  35.71 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  34.52 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>