221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4804 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  729    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  34.08 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  31.48 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  51.76 
 
 		 203 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  47.13 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  45.98 
 
 		 206 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  47.13 
 
 		 207 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.29 
 
 		 206 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  45.98 
 
 		 206 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  47.19 
 
 		 207 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  48.81 
 
 		 204 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  45.98 
 
 		 206 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  36.29 
 
 		 206 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  47.13 
 
 		 206 aa  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  50 
 
 		 131 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  47.13 
 
 		 207 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  42.05 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  46.43 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  45.98 
 
 		 207 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  45.98 
 
 		 207 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  47.13 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  47.62 
 
 		 205 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  44.83 
 
 		 206 aa  86.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  39.29 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  39.77 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  44.83 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  39.77 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  39.77 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  39.77 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  39.77 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  41.86 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  42.53 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  41.38 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  44.05 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  40 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  38.37 
 
 		 206 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  37.5 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  41.18 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  42.17 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  39.08 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  37.5 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  39.53 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  39.77 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  39.77 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  38.39 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  39.77 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  36.47 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  38.1 
 
 		 203 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  40 
 
 		 403 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  34.09 
 
 		 202 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  41.67 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  34.88 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  33.72 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  39.53 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.88 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  38.36 
 
 		 112 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  40.79 
 
 		 252 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  40.51 
 
 		 190 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  41.1 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  37.21 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  34.52 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  43.08 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  35.44 
 
 		 121 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  36.36 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  37.5 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  42.86 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  35.63 
 
 		 115 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  42.86 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  34.18 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  30.99 
 
 		 245 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  28.21 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  31.03 
 
 		 205 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  32.18 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  34.15 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  38.81 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  41.79 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  33.33 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  28.71 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  33.33 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  30.86 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  28.71 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  40.91 
 
 		 223 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  38.03 
 
 		 467 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  33.73 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  36.25 
 
 		 138 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  41.27 
 
 		 184 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  36.23 
 
 		 202 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  31.03 
 
 		 447 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  40.3 
 
 		 208 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  38.1 
 
 		 218 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  39.71 
 
 		 223 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  38.46 
 
 		 251 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 		 459 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  35 
 
 		 275 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  40 
 
 		 462 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2087  TonB family protein  28.57 
 
 		 219 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.000490312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  31.71 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  34.67 
 
 		 209 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  36.71 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.71 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>