94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1494 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 582 aa  1132    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  50.62 
 
 		 244 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  44.58 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1290  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.13 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0190271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  39.29 
 
 		 237 aa  72.8  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2544  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.45 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.108185 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1378  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.45 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1356  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.45 
 
 		 399 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0896  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.45 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.225893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4523  diguanylate cyclase  32.77 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114375  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  32.53 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  38.16 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  31.43 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  35.37 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 845 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  36.36 
 
 		 160 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  36.36 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  32.5 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  34.19 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  33.61 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  33.75 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 929 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  37.97 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  34.15 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  39.76 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  30.71 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  35.71 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  37.21 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  28.19 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  31.17 
 
 		 332 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.56 
 
 		 206 aa  57  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2183  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.79 
 
 		 336 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  31.82 
 
 		 700 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  26.8 
 
 		 368 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  37.35 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.27 
 
 		 259 aa  56.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  33.33 
 
 		 267 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  28.57 
 
 		 206 aa  55.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  28.57 
 
 		 206 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  34.48 
 
 		 243 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  32.53 
 
 		 207 aa  53.9  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  32.53 
 
 		 207 aa  53.9  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  29.37 
 
 		 206 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  29.37 
 
 		 206 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  29.27 
 
 		 206 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  26.83 
 
 		 206 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  28.57 
 
 		 206 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  32 
 
 		 210 aa  50.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  36.14 
 
 		 206 aa  50.8  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  28.92 
 
 		 212 aa  50.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  26.51 
 
 		 225 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  50.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  29.87 
 
 		 308 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  33.33 
 
 		 244 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  33.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  33.33 
 
 		 239 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  36.05 
 
 		 240 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  36.05 
 
 		 242 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  36.05 
 
 		 242 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  36.05 
 
 		 242 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  33.33 
 
 		 244 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  30.77 
 
 		 248 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  32.47 
 
 		 193 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  32 
 
 		 289 aa  49.7  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  28.89 
 
 		 219 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.47 
 
 		 244 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.47 
 
 		 244 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  32.47 
 
 		 248 aa  48.5  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.89 
 
 		 245 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  35.06 
 
 		 413 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  34.88 
 
 		 240 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  32.89 
 
 		 138 aa  47.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  33.77 
 
 		 275 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  33.33 
 
 		 390 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  33.33 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  35 
 
 		 249 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  36.99 
 
 		 334 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  32.47 
 
 		 244 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  32.47 
 
 		 305 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1261 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  29.49 
 
 		 342 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  34.33 
 
 		 223 aa  44.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  30.48 
 
 		 252 aa  44.3  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  32.94 
 
 		 280 aa  44.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  32.91 
 
 		 443 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  29.11 
 
 		 287 aa  44.3  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  32.05 
 
 		 274 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4702  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.11 
 
 		 464 aa  43.9  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.781083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  32.56 
 
 		 251 aa  43.9  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  27.85 
 
 		 276 aa  43.9  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>