142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4383 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  100 
 
 		 700 aa  1423    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  29.38 
 
 		 631 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  32.35 
 
 		 651 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  29.97 
 
 		 581 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  31.58 
 
 		 660 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  30.07 
 
 		 750 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  30.48 
 
 		 477 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  27.81 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  29.01 
 
 		 598 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  41.75 
 
 		 423 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  27.63 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  26.99 
 
 		 585 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  26.99 
 
 		 585 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  26.99 
 
 		 585 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.29 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  27.72 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  25 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.25 
 
 		 858 aa  67.8  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  24.32 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  32.5 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  26.34 
 
 		 640 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.93 
 
 		 228 aa  66.6  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  24.78 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25.85 
 
 		 632 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  24.78 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  34.51 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  35.29 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  21.5 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  35.56 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  27.41 
 
 		 462 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  30.95 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  36.36 
 
 		 664 aa  63.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  39.02 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  26.67 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  30.89 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.4 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  31.82 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.18 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  29.25 
 
 		 750 aa  58.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  27.98 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  37.04 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  29.27 
 
 		 330 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30.59 
 
 		 582 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  31.31 
 
 		 210 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  28.92 
 
 		 259 aa  56.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  31.17 
 
 		 368 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 		 617 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  27.87 
 
 		 330 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.58 
 
 		 245 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  25.19 
 
 		 719 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 		 459 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  30.16 
 
 		 322 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  28.74 
 
 		 405 aa  55.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  34.88 
 
 		 467 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  30.95 
 
 		 227 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  34.57 
 
 		 392 aa  53.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  28.57 
 
 		 447 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  32.35 
 
 		 441 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  24.36 
 
 		 632 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  24.18 
 
 		 631 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  31.76 
 
 		 565 aa  52  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  36.59 
 
 		 207 aa  51.6  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  29.21 
 
 		 253 aa  50.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  33.75 
 
 		 223 aa  50.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  29.9 
 
 		 248 aa  50.8  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  28.42 
 
 		 234 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  31.65 
 
 		 283 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  33.77 
 
 		 221 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  35.8 
 
 		 206 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  32.18 
 
 		 288 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  31.17 
 
 		 590 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  29.03 
 
 		 458 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  33.73 
 
 		 215 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  29.89 
 
 		 228 aa  49.7  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  33.33 
 
 		 131 aa  50.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  33.77 
 
 		 221 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  38.33 
 
 		 115 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  35.8 
 
 		 207 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  26.17 
 
 		 244 aa  49.3  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  35.8 
 
 		 206 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  31.25 
 
 		 206 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  35.8 
 
 		 207 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  35.8 
 
 		 206 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  32.18 
 
 		 287 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  27.14 
 
 		 324 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  28.66 
 
 		 404 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  31.08 
 
 		 256 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  31.08 
 
 		 252 aa  48.5  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  31.08 
 
 		 256 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  29.06 
 
 		 252 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  31.25 
 
 		 206 aa  47.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  35.06 
 
 		 259 aa  47.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  28.57 
 
 		 319 aa  47.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  28.57 
 
 		 243 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  40 
 
 		 260 aa  47  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  34.57 
 
 		 207 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  34.57 
 
 		 207 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  26.53 
 
 		 243 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  31.17 
 
 		 233 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  24.48 
 
 		 302 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>