74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3297 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 423 aa  846    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  33.01 
 
 		 671 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  35.18 
 
 		 581 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  30.32 
 
 		 598 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  35.96 
 
 		 750 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  38.51 
 
 		 660 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  31.9 
 
 		 651 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  31.65 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  30.1 
 
 		 477 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  41.75 
 
 		 700 aa  97.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  36.84 
 
 		 541 aa  93.2  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  38.41 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  23.85 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  24.86 
 
 		 596 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  27.15 
 
 		 617 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  25.66 
 
 		 858 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  29.35 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  32.3 
 
 		 719 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  30.25 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  25.56 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  28.83 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  25.52 
 
 		 585 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  32.5 
 
 		 322 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  25.52 
 
 		 585 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  25.52 
 
 		 585 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27.04 
 
 		 405 aa  67  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  27.5 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  23.6 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  30.82 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  31.03 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  24.54 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  28.87 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  29.55 
 
 		 590 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  27.68 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  25.21 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  27.01 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  30.72 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  34.95 
 
 		 631 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  28.48 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  32.37 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  32.11 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  30.63 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  25.79 
 
 		 629 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  24.81 
 
 		 562 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  25.79 
 
 		 629 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  23.5 
 
 		 632 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25.79 
 
 		 632 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  30.77 
 
 		 640 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25.62 
 
 		 589 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  31.73 
 
 		 664 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  21.39 
 
 		 585 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  22.22 
 
 		 585 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  36 
 
 		 583 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  18.81 
 
 		 585 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  28.86 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  29.63 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  26.16 
 
 		 519 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  32.43 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  23.39 
 
 		 647 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  24.64 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  23.91 
 
 		 524 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  27.22 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  28.72 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  28.57 
 
 		 556 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  24.89 
 
 		 621 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  29.55 
 
 		 747 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  39.29 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  30.99 
 
 		 604 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  28.79 
 
 		 624 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3075  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 		 576 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  23.9 
 
 		 328 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>