110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0456 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  29.09 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  40.66 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.88 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  36 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  31.96 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  34.23 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  41.25 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  40.96 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  38.1 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  34.12 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  34.12 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  41.25 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  35 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  34.07 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  31.09 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  34.78 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  28.7 
 
 		 112 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  34.52 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  36.76 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.5 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.9 
 
 		 287 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  36.17 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  33.73 
 
 		 276 aa  52  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  32.53 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  28.69 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  38.3 
 
 		 269 aa  51.6  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  25.33 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  32.48 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  33.75 
 
 		 700 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  28.75 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  30.51 
 
 		 565 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  36.78 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  36.78 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  35.05 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  25.76 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  39.71 
 
 		 371 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  30.09 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  30.95 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  31.25 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  34.52 
 
 		 288 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  37.18 
 
 		 249 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  31.33 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  31.91 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  30.95 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  26.81 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  29.49 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  32.97 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  38.03 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  35 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  28.46 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  32.53 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  32.14 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  38.24 
 
 		 371 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  32.53 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  32.14 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  26.26 
 
 		 367 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  32.63 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  30.61 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  31.63 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  30.61 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  35.44 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  28.21 
 
 		 370 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  32.5 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  35.8 
 
 		 283 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  29.59 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  27.84 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35.37 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  29.76 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  33.73 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  29.47 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  30 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  34.94 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  32.18 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  32.18 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  34.41 
 
 		 475 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  34.94 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  29.81 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  39.39 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  29.59 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  26.92 
 
 		 369 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  26.92 
 
 		 370 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  33.33 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  34.12 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  25.18 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  28.74 
 
 		 368 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  29.21 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  29.21 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  33 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  27.63 
 
 		 373 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  30.39 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  29 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  35.44 
 
 		 134 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  32.93 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  28.21 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  28.21 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  30.69 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  32.61 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  31.33 
 
 		 274 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  30.56 
 
 		 363 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>