149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3311 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  100 
 
 
232 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  76.86 
 
 
233 aa  275  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  76.42 
 
 
233 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  70.59 
 
 
234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  60.76 
 
 
233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  52.42 
 
 
256 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  55 
 
 
259 aa  177  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  48.62 
 
 
233 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  57.47 
 
 
253 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  38.5 
 
 
212 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  43.98 
 
 
244 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  43.98 
 
 
244 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  52.87 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  54.32 
 
 
117 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.97 
 
 
287 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  38.93 
 
 
193 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  48.28 
 
 
270 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  48.28 
 
 
264 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  42.22 
 
 
288 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  44.32 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  42.24 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  45.35 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  50.56 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  50.56 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  46.67 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  50.56 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  46.07 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  46.07 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  43.82 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  41.12 
 
 
271 aa  82  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  47.19 
 
 
275 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  51.28 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  45.98 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  41.76 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  50 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  48.84 
 
 
264 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  45.88 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  45.88 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  46.75 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  47.67 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  43.04 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  42.53 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  43.02 
 
 
268 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  41.86 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  39.08 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  40.48 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  42.68 
 
 
332 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  39.83 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  38.1 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  37.23 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  41.38 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  35.96 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  45.45 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  38.37 
 
 
275 aa  62.8  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  37.65 
 
 
289 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  44.87 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  33.96 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.94 
 
 
249 aa  61.6  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  44 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  40.7 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  39.02 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  39.74 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  33.02 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  39.33 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  38.54 
 
 
2179 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  41.57 
 
 
269 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  39.02 
 
 
226 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  33.56 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  39.08 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  33.68 
 
 
277 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  36.54 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  42.35 
 
 
267 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  35.24 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  37.35 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  38.1 
 
 
301 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  38.46 
 
 
229 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  38.46 
 
 
229 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  38.81 
 
 
226 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  37.97 
 
 
230 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  38.81 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  38.81 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  46.55 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.72 
 
 
237 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  36.47 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  40.58 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  38.14 
 
 
2272 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  27.95 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  41.18 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  37.7 
 
 
231 aa  52  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  31.33 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  29.38 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  38.75 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  33.33 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  28.57 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  36.71 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  43.33 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>