147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0674 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  100 
 
 		 267 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  70.37 
 
 		 269 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  62.35 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  62.35 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  62.35 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  59.78 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  59.78 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  58.7 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  37.07 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  60 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  60 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  56.47 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  56.47 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  40.22 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  48.03 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  55.56 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  58.54 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  58.54 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  54.12 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  45.24 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  51.76 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  51.49 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  60 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  50.59 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  50.59 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  43.2 
 
 		 193 aa  86.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  36 
 
 		 244 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  36 
 
 		 244 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  35.8 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  47.06 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  51.65 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  49.38 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  44.71 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  44.71 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  41.86 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  43.53 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  44.16 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  45.68 
 
 		 117 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  34.93 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  44.19 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  50.75 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  42.17 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  42.35 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  44.05 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  41.82 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  43.04 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  44.66 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  36.59 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  43.27 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  37.08 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  30.8 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  32 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  27.78 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  39.02 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  37.66 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  45.45 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  45.45 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  39.44 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  42.31 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  42.31 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  37.97 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  36.9 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.35 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  40.26 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  30 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1664  TonB/TolA energy transducing protein  38.37 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0106366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.87 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  40.96 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  25.22 
 
 		 203 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  31.05 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  35.37 
 
 		 357 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  41.56 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  47.54 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  40 
 
 		 441 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  31.38 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  29.94 
 
 		 443 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  31.46 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  35.8 
 
 		 138 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  35.29 
 
 		 475 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  37.04 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  36.71 
 
 		 413 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  35.37 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3346  TonB family protein  39.39 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  37.04 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  31.58 
 
 		 582 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  36.71 
 
 		 390 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  35.16 
 
 		 238 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  31.19 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  32.5 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  26.75 
 
 		 227 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  28.99 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  32.66 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  38.67 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  34.67 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  35.87 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  27.78 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  28.83 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>