153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3076 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  100 
 
 		 234 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  67.8 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  64.71 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  65.55 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  52.38 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  51.49 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  54.26 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  45.21 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  60.92 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  39.22 
 
 		 212 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  41.33 
 
 		 193 aa  98.2  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  49.15 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  49.15 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  51.72 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  39.04 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  39.1 
 
 		 287 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  50 
 
 		 117 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  39.34 
 
 		 271 aa  86.3  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  46.07 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  46.07 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  47.78 
 
 		 274 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  43.82 
 
 		 288 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  47.67 
 
 		 270 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  46.07 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  46.07 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  46.24 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  47.67 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  46.43 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  47.73 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  47.73 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  48.31 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  48.31 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  48.31 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  49.41 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  40.91 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  37.61 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  48.28 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  41.94 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  46.99 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  43.68 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  44.16 
 
 		 390 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  46.15 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  47.13 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  42.59 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  39.78 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  44.26 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  44.26 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  35.25 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  46.25 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  47.89 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  43.04 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  41.18 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  42.31 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  44.87 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  34.51 
 
 		 2113 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  37.93 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  41.57 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  37.93 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  35.23 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  40 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  39.47 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  36.78 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  43.53 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  35.79 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  42.25 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  42.25 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  32.41 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  38.16 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  33.91 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  37.8 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  37.21 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  38.46 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  35.44 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  37.8 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  39.08 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  43.04 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  37.8 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  40.51 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  41.1 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  33.33 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  36.47 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  46.55 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  39.51 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  45.57 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  35.71 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  29.17 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  27.66 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1987  TonB family protein  33.33 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40.26 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  32.94 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  36.71 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40.26 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  38.1 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  30.65 
 
 		 475 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  34.15 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  34.55 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  34.15 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  34.15 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>