208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3521 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  43.48 
 
 		 277 aa  88.2  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  38.78 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  32.97 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.48 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  32.71 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  32.78 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  31.11 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  25.56 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  24.77 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  39.13 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  24.66 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  37.63 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  35 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.96 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  35 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  34.11 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  37.5 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  33.75 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  37.5 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  37.5 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  35.06 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.25 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.25 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  36.25 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  36.25 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  34.57 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  36.25 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  36.25 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  35.06 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  37.5 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  36.9 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  36.9 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  33.73 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.12 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.35 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  36.9 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  32.58 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  35.9 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  25 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  31.71 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  31.58 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  31.09 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  32.61 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  33.33 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  26.4 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  31.68 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  32.47 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  34.78 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  36.36 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  39.13 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  37.33 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  35.42 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  30.97 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.05 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  35.06 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  32.89 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.05 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  29.49 
 
 		 369 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  32.89 
 
 		 404 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  28.83 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  35.06 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  33.33 
 
 		 117 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  29.82 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  35.06 
 
 		 270 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  31.65 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  32.5 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  33.75 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  31.17 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  35.44 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  33.33 
 
 		 275 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  31.65 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  34.88 
 
 		 332 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  35.06 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  33.33 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  28.75 
 
 		 349 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  32.05 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  32.5 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  34.18 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  31.65 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  30.67 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  28.92 
 
 		 582 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  31.58 
 
 		 405 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  34.12 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  31.18 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  31.58 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  31.58 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  31.43 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  35.87 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  32.95 
 
 		 121 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  35.06 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  27.61 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  32.47 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  32.05 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  35.06 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  28.36 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  30 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  31.34 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>