173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0995 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  100 
 
 		 208 aa  411  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  34.4 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  41.76 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.44 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  40.66 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  43.21 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  40.66 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  44.44 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  41.76 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  37.04 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  34.39 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  42.35 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  41.98 
 
 		 117 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  45.68 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  38.53 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  38.53 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  46.84 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  43.94 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  33.96 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.94 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  42.86 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  40.45 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  39.22 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  39.77 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  40 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  40.58 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  34.62 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  39.02 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  37.72 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  40.48 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  42.31 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  39.02 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  37.78 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  36 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  36.78 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  36.22 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  36 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  35.87 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  37.04 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  34.57 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  35.8 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  44.16 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  43.04 
 
 		 447 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  35.8 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  34.74 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  35.8 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  41.56 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  36.59 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  35.8 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  37.18 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  41.03 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  40.3 
 
 		 349 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  37.97 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  39.24 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  34.15 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  36.59 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  34.15 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  34.15 
 
 		 286 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  34.57 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  35.8 
 
 		 267 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  34.57 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  51.02 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  39.74 
 
 		 332 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  36.84 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  35.44 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  34.62 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  34.57 
 
 		 266 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  35 
 
 		 277 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  34.57 
 
 		 266 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  35.8 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  35.8 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  34.18 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  35.8 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  39.19 
 
 		 325 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  34.78 
 
 		 507 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  34.94 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  47.62 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  37.97 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  39.51 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  34.09 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  33.66 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  47.92 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  35.9 
 
 		 248 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1604  TonB family protein  37.66 
 
 		 243 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  35 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  46.67 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1509  TonB family protein  38.96 
 
 		 244 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00129543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  47.5 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0117  TonB family protein  32.04 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  38.24 
 
 		 267 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  27.5 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  35.9 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  37.14 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  35.96 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  34.57 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  34.57 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  34.57 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  32.89 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  28.81 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>