120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06244 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  37.65 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  41.25 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.63 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  40.26 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  38.37 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  35.9 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  35.71 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  44.16 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  44.16 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  36 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  35.9 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  29.41 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  37.66 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.77 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.77 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  33.33 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  33.33 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  41.56 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  33.77 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  34.34 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  33.33 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  35.71 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  33.33 
 
 		 215 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  35.8 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.93 
 
 		 270 aa  51.2  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  34.62 
 
 		 260 aa  51.2  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  35.8 
 
 		 248 aa  50.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  31.37 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  34.21 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.47 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  36.25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  34.57 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.05 
 
 		 459 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  41.54 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  35.8 
 
 		 302 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  35 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  33.77 
 
 		 565 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.57 
 
 		 249 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  35.8 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.5 
 
 		 237 aa  48.9  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  34.18 
 
 		 228 aa  48.5  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  31.71 
 
 		 215 aa  48.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  32.89 
 
 		 349 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  38.67 
 
 		 447 aa  48.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  32.05 
 
 		 269 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  38.46 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  32.91 
 
 		 396 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  39.39 
 
 		 271 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  40.51 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  32.1 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  32.5 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  31.33 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  32.29 
 
 		 391 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  31.17 
 
 		 283 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  32.91 
 
 		 331 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  32.05 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  33.75 
 
 		 274 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  30.77 
 
 		 403 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  32.93 
 
 		 280 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  30 
 
 		 259 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  33.33 
 
 		 275 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  31.33 
 
 		 256 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  33.75 
 
 		 286 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  29.87 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  37.88 
 
 		 273 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4592  TonB family protein  34.18 
 
 		 227 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  34.94 
 
 		 234 aa  44.3  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  33.33 
 
 		 287 aa  44.3  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  36.36 
 
 		 342 aa  44.3  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  37.88 
 
 		 274 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  35 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  31.58 
 
 		 467 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0897  TonB protein  35.9 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  33.33 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  31.25 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  31.91 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  32.61 
 
 		 441 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  31.65 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  36 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0306  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  33.77 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  31.25 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  31.71 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  30.11 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  29.63 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  32.1 
 
 		 319 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  31.17 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  33.77 
 
 		 417 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  33.78 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  26.67 
 
 		 274 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  28.21 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  34.94 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  28.92 
 
 		 277 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  35.44 
 
 		 285 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  25.64 
 
 		 244 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  35.06 
 
 		 237 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>