77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4100 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  36.89 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2647  TonB family protein  31.63 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0201451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  28.67 
 
 		 565 aa  62  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  41.77 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  36.25 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  37.5 
 
 		 466 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  33.33 
 
 		 458 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  36.59 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  34.09 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  36.36 
 
 		 392 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  36.84 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  32.88 
 
 		 260 aa  48.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  33.33 
 
 		 403 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  32.93 
 
 		 115 aa  48.5  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  34.04 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  33.33 
 
 		 859 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  29.21 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  32.43 
 
 		 405 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  31.71 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  36 
 
 		 121 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  34.18 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  36.99 
 
 		 582 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  33.77 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  38.16 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  34.21 
 
 		 131 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.75 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4364  hypothetical protein  30.77 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  32.74 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  26.35 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  29.9 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  36.92 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  30 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  32 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  32.1 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  32.88 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  31.58 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  30.86 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  30.86 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.68 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  30.86 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  32.1 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  29.63 
 
 		 700 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  30.86 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  32.1 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  32.1 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  33.33 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2818  hypothetical protein  31.63 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.654344  hitchhiker  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  35.29 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  33.33 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  32.14 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  35.71 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  35.71 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  36.36 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  35.71 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.4 
 
 		 459 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  36.49 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  31.71 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  36.92 
 
 		 417 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  32.91 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  27.5 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2154  hypothetical protein  29.21 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  35.71 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  35.71 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  34.57 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  30.11 
 
 		 170 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  30.11 
 
 		 170 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  28.7 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.11 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  31.51 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  35.53 
 
 		 184 aa  42.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  32.14 
 
 		 298 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  30.38 
 
 		 361 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  32.26 
 
 		 447 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  31.88 
 
 		 390 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  28.16 
 
 		 354 aa  41.6  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>