27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1010 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  100 
 
 
466 aa  911    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  30.97 
 
 
565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  38.78 
 
 
220 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  35.23 
 
 
362 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  28.43 
 
 
252 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2647  TonB family protein  32.09 
 
 
266 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0201451  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  37.5 
 
 
234 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.42 
 
 
459 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  32.53 
 
 
368 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  32.99 
 
 
361 aa  50.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  33.63 
 
 
134 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  32.99 
 
 
228 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  40.35 
 
 
121 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  36 
 
 
237 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  36.76 
 
 
269 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  36.51 
 
 
112 aa  46.6  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  32.99 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  39.39 
 
 
260 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  35.62 
 
 
363 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  34.67 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  33.33 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  32.5 
 
 
238 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.72 
 
 
217 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  29.87 
 
 
371 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  36.84 
 
 
227 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  34.85 
 
 
447 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  32.05 
 
 
137 aa  43.1  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>