182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1422 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  100 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  53 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  47.06 
 
 		 447 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  47.13 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  37.5 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  37.25 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  38.14 
 
 		 438 aa  68.9  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  38.46 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  38.83 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  35.51 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  31.15 
 
 		 506 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  32.71 
 
 		 668 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  35.64 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  34.55 
 
 		 489 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  35.71 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  42.31 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  37.18 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  35.92 
 
 		 143 aa  62  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  30.33 
 
 		 276 aa  62  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  36.36 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  28.57 
 
 		 804 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  40.26 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  36.52 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  29.41 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  40.51 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  40.51 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  37.66 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  38.96 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  44.19 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  31.63 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  38.67 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.01 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  35.06 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  44.19 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  33.77 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  44.19 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  38.67 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  32.35 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  44.74 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  36.67 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  30.91 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  41.33 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.33 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  35.71 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  43.42 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  33.33 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  32.98 
 
 		 565 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  39.47 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  32.91 
 
 		 484 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  39.47 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  35.48 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  40.79 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  31.25 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  38.67 
 
 		 137 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  40.79 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  36 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  38.16 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  38.67 
 
 		 137 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  38.16 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  36.84 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  38.16 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  33.33 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  38.16 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  38.16 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  28.21 
 
 		 112 aa  52.4  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  41.33 
 
 		 140 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  40 
 
 		 117 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  31.91 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  31.4 
 
 		 467 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  38.67 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  38.16 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  38.67 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  27.64 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.53 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  37.5 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  38.16 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  38.16 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  37.5 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  38.16 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  31.25 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  35.06 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  36.71 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  29.81 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  40 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  35.8 
 
 		 441 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  27.37 
 
 		 134 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  38.16 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  31.48 
 
 		 138 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  34.21 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  33.33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  34.21 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  48.39 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  35.14 
 
 		 614 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  37.21 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  35.53 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.14 
 
 		 459 aa  48.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  37.65 
 
 		 264 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0583  TonB family protein  35.9 
 
 		 129 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  35.53 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  29.9 
 
 		 193 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>