76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2591 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  100 
 
 		 275 aa  547  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  67.74 
 
 		 156 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  43.75 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  43.94 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  41.42 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  57.64 
 
 		 668 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  36.09 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  34.96 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  34.05 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  34.06 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  32.13 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  44.54 
 
 		 506 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  31.64 
 
 		 804 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  45.63 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  52.17 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  46.15 
 
 		 156 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  45.19 
 
 		 150 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  48.94 
 
 		 143 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  47.42 
 
 		 489 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  44.12 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  30.04 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  41.59 
 
 		 172 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  45.1 
 
 		 438 aa  95.5  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4087  hypothetical protein  52.17 
 
 		 100 aa  92.8  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  44.57 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  41.18 
 
 		 485 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  34.31 
 
 		 604 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  42 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  40.95 
 
 		 413 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  32.48 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35.29 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  32.29 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  41.56 
 
 		 446 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  36.67 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  27.41 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  32.28 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  30.12 
 
 		 583 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  34.94 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  32.35 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  29.35 
 
 		 122 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  28.57 
 
 		 447 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  41.33 
 
 		 467 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.18 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  38.67 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  27.93 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  31.03 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  32.89 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  31.03 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  37.33 
 
 		 614 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  32.89 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  36.71 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4165  TonB family protein  34.62 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000230804  hitchhiker  0.00000000895205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  34.57 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  33.33 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  35.9 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  29.33 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  35.06 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  32.93 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  30.12 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  28.95 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  33.33 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  30.48 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  29.79 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  32.89 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.67 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  34.62 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  28.95 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  33.33 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  32.58 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  28.92 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  29.58 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  31.82 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  30.49 
 
 		 236 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  32 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  32.1 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>