55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5008 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  94.42 
 
 		 233 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  94.42 
 
 		 233 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  94.42 
 
 		 233 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  74.68 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  65.55 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  72.96 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  66.96 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  63.76 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  65.6 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  54.37 
 
 		 212 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  52.08 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  28.36 
 
 		 447 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  39.29 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  33.73 
 
 		 485 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  38.16 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  48.94 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  34.15 
 
 		 668 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  43.48 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  29.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  34.12 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  36.14 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  46.15 
 
 		 413 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36.14 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  37.68 
 
 		 371 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  42.86 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.78 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.78 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  36.59 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  30.85 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.33 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  36.23 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  38.16 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  30 
 
 		 2113 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  36.21 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  35.16 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  30.56 
 
 		 115 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  27.2 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  33.96 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  35.71 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  38.16 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3173  hypothetical protein  25.91 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  28.68 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  26.42 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  28.3 
 
 		 438 aa  43.5  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  32.1 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  34.62 
 
 		 565 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  37.66 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  28.02 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  33.75 
 
 		 317 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  32.47 
 
 		 243 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  26.19 
 
 		 268 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  32.89 
 
 		 215 aa  42  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>