146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0491 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  100 
 
 		 283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  54.39 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  48.45 
 
 		 267 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  54.44 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  50 
 
 		 269 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  37.4 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  45.98 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.38 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  35.9 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  30.95 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  37.37 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  37.97 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  41.25 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  39.53 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  37.93 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  39.19 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  35.79 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  38.67 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  34.94 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  40.23 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  34.12 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  29.38 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  37.7 
 
 		 441 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  30.77 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  38.67 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  38.96 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  36.28 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  40.23 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  38.27 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  35.23 
 
 		 134 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  40.26 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.37 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  40 
 
 		 212 aa  52.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  38.2 
 
 		 206 aa  52.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  44.78 
 
 		 206 aa  52.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  34.21 
 
 		 121 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  29.48 
 
 		 193 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1987  TonB family protein  33.33 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  35.23 
 
 		 668 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  40.24 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  37.04 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  37.04 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  35.06 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  40.24 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  37.93 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  41.79 
 
 		 206 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  32.69 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  37.66 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  32.22 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  38.04 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  38.75 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  33.62 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  30.68 
 
 		 156 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  32.18 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  38.55 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  38.67 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  38.55 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  33.33 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30.68 
 
 		 218 aa  48.9  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  38.55 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  40.26 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  32.89 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35.44 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  34.15 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  34.62 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  33.77 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  36.25 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  31.65 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  35.44 
 
 		 369 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  37.33 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  33.72 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  37.66 
 
 		 117 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  39.24 
 
 		 215 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  34.62 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  35.14 
 
 		 143 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  34.94 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  37.5 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  34.62 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  37.97 
 
 		 865 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  31.17 
 
 		 170 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  31.17 
 
 		 170 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  31.71 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  34.94 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  35 
 
 		 413 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  33.72 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  40.74 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  37.04 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4650  TonB family protein  34.67 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0654653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  40.74 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  31.71 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  29.11 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  29.11 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  35.05 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  40.74 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  42.37 
 
 		 906 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  35.8 
 
 		 223 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  30.49 
 
 		 245 aa  45.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  32.98 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  35.71 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  38.46 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>