138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1093 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  44.54 
 
 		 459 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  46.51 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  38.3 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  41.67 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  39.29 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  38.82 
 
 		 390 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.33 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  38.64 
 
 		 319 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  31.87 
 
 		 614 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  34.51 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  35.71 
 
 		 565 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  37.21 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  37.35 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  30.71 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  35.23 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  37.78 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.14 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  33.33 
 
 		 275 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1218  TonB-like protein  30.43 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0834561  normal  0.166487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  33.33 
 
 		 277 aa  52  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  40.48 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  34.48 
 
 		 244 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  28.7 
 
 		 301 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  32.79 
 
 		 403 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  34.48 
 
 		 244 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  31.71 
 
 		 244 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  27.05 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  31.76 
 
 		 215 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  27.37 
 
 		 238 aa  50.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  38.46 
 
 		 228 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  29.06 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  24.68 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  27.06 
 
 		 582 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  30.59 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  28.24 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  33.77 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  40.62 
 
 		 443 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  33.63 
 
 		 466 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  33.77 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  32.97 
 
 		 258 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.47 
 
 		 270 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  34.52 
 
 		 249 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  30.95 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  33.33 
 
 		 332 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  34.94 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  33.77 
 
 		 248 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  29.27 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  33.77 
 
 		 193 aa  47.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  35.06 
 
 		 274 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  35.06 
 
 		 275 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  35.06 
 
 		 286 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  32.14 
 
 		 392 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  33.8 
 
 		 368 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  33.33 
 
 		 290 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  30.95 
 
 		 269 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  36.05 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  37.31 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  26.02 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  37.31 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  36.51 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  37.31 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  27.85 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  36.51 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  36.51 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  37.31 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  37.31 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  29.87 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  29.87 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  29.89 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  37.31 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  37.31 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  37.31 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  35.71 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  29.87 
 
 		 413 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  31.71 
 
 		 207 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  32.88 
 
 		 234 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  33.33 
 
 		 253 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  26.13 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  33.33 
 
 		 405 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  32.47 
 
 		 270 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  27.37 
 
 		 447 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  32.84 
 
 		 391 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  33.72 
 
 		 441 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  33.33 
 
 		 668 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  32.5 
 
 		 249 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  33.33 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  37.21 
 
 		 240 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  35.71 
 
 		 203 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  32.56 
 
 		 243 aa  43.9  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  30.61 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  30.34 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  37.97 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  26.97 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  35.71 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  32.47 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  32.14 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  29.87 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  29.87 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  38.1 
 
 		 342 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>