47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0810 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  100 
 
 
614 aa  1236    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  31.87 
 
 
134 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  39.39 
 
 
150 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  35.29 
 
 
332 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  37.04 
 
 
582 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  33.33 
 
 
237 aa  54.3  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  32.1 
 
 
215 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  31.4 
 
 
277 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  34.12 
 
 
390 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  36.25 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  36.71 
 
 
244 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.26 
 
 
270 aa  50.8  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  36.36 
 
 
245 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  28.24 
 
 
269 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  31.71 
 
 
112 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.67 
 
 
258 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.06 
 
 
259 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  38.67 
 
 
668 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  35.14 
 
 
238 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  34.62 
 
 
228 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  31.25 
 
 
217 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  34.62 
 
 
305 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.8 
 
 
244 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.8 
 
 
244 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  35.63 
 
 
342 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  30.68 
 
 
210 aa  47.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  34.62 
 
 
253 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  33.33 
 
 
342 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  37.33 
 
 
275 aa  47.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  32.05 
 
 
308 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  30.38 
 
 
255 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  33.78 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  31.03 
 
 
367 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  34.62 
 
 
228 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  33.33 
 
 
215 aa  45.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  32.14 
 
 
121 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  34.48 
 
 
298 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  37.33 
 
 
156 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  37.1 
 
 
160 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  30.26 
 
 
220 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  38.24 
 
 
271 aa  44.3  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  36.36 
 
 
228 aa  43.9  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  33.33 
 
 
219 aa  43.9  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  33.33 
 
 
219 aa  43.9  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35 
 
 
280 aa  43.9  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  25.32 
 
 
156 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  34.62 
 
 
234 aa  43.5  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>