60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3214 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  100 
 
 		 357 aa  706    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  38.27 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  33.33 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.59 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.5 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  35.37 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  41.03 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  35.11 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  36.14 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  42.31 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  37.66 
 
 		 447 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  36.25 
 
 		 614 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  36.59 
 
 		 276 aa  53.5  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.08 
 
 		 215 aa  53.1  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  33.7 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  35.37 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  38.16 
 
 		 249 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  38.55 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  38.55 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  34.15 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  31.33 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  39.13 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  38.55 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  34.21 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  34.21 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  27.87 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  35.37 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  36.59 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  39.13 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  37.8 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  36.49 
 
 		 221 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  37.84 
 
 		 258 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.97 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  36.59 
 
 		 264 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  36.59 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  31.33 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  32.05 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  34.15 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  35.14 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  36.59 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  30.67 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  32.94 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  32 
 
 		 804 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  31.4 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  32.5 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  32.18 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  36.17 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  36.59 
 
 		 244 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  30.67 
 
 		 156 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  32.47 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  29.87 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  26.51 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  32.47 
 
 		 220 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4650  TonB family protein  34.55 
 
 		 292 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0654653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  31.71 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  31.71 
 
 		 280 aa  43.1  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  36.23 
 
 		 267 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  30.12 
 
 		 248 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  35.8 
 
 		 938 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>