110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4058 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  100 
 
 		 274 aa  541  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  73.45 
 
 		 274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  48.13 
 
 		 276 aa  231  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  44.32 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  42.38 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  46.49 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  41.03 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  60.98 
 
 		 506 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  36.53 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  36.43 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  48.68 
 
 		 156 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  60.58 
 
 		 472 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  48.85 
 
 		 804 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  47.62 
 
 		 156 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  51.69 
 
 		 150 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  54.13 
 
 		 484 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  53.76 
 
 		 143 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  52.94 
 
 		 668 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  59.38 
 
 		 489 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  48.6 
 
 		 230 aa  116  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  55.88 
 
 		 485 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  28.94 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  47.42 
 
 		 379 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  40.46 
 
 		 604 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  37.31 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  45.26 
 
 		 438 aa  98.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  44.66 
 
 		 258 aa  92.4  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  42.86 
 
 		 222 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  48.81 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  37.5 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  38.26 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  31.69 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  31.96 
 
 		 143 aa  72  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  34.29 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  44.74 
 
 		 446 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  37.5 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  34.43 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  30.28 
 
 		 583 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  28.95 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  29.39 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.26 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  37.66 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  37.66 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  27.97 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  31.25 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  34.52 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  26.82 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  31.58 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  39.74 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  35.71 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  33.33 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  26.57 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  31.86 
 
 		 467 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  31.17 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  26.67 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4087  hypothetical protein  43.75 
 
 		 100 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2309  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  32.26 
 
 		 301 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  33.33 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  31.52 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  35.8 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  31.37 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  34.62 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6079  hypothetical protein  31.82 
 
 		 196 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0189  hypothetical protein  36.49 
 
 		 437 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.562826 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  32.56 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  32.89 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  32.56 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  32.56 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  32.89 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  33.33 
 
 		 614 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  28.24 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  32.56 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  32.56 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  32.56 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  32.56 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  36.51 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  32.14 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  30.67 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  38.16 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  38.55 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  31.58 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  30.26 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  31.58 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  33.75 
 
 		 368 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  32.47 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  34.18 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  33.93 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  33.93 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  32.89 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  31.17 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  35.06 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  29.9 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  28.95 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  30.77 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  33.33 
 
 		 441 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  29.33 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  28.57 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  32.56 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>