174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1537 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  100 
 
 
261 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  55.91 
 
 
265 aa  125  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  46.92 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  56.18 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  33.04 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  45.05 
 
 
164 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  45.05 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  40.77 
 
 
292 aa  79  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  38.71 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  41.38 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  35.29 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  37.93 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  36.14 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  33.33 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  33.7 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  42.7 
 
 
316 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  31.3 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  38.89 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  34.83 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  24.84 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  32.63 
 
 
201 aa  59.3  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  28.03 
 
 
308 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  32.79 
 
 
241 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  37.14 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  26.83 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  33.33 
 
 
336 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  56 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  30.59 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  37.18 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  37.18 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  34.69 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  33.98 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  35.8 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  34.41 
 
 
305 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  37.8 
 
 
233 aa  52.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  36.11 
 
 
323 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  36.67 
 
 
235 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  32.93 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  36.11 
 
 
323 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  27.48 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  40 
 
 
288 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  32.18 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  34.94 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  33.33 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  34.52 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  34.67 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  24.84 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  34.67 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  33.72 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  35 
 
 
317 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  34.67 
 
 
284 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  35.8 
 
 
447 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  37.21 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  26.85 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  46 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  32.94 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  32.26 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  34.67 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  50.98 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  28.05 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  30.95 
 
 
310 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0853  TonB-like  34.16 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  32.14 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  35.23 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  30.77 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  37.61 
 
 
390 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  38.03 
 
 
300 aa  48.9  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  39.29 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  32.94 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  40.38 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.33 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  31.08 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  38.46 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  41.07 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  28.45 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  30.93 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  34.67 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  34.52 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  28.21 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  39.44 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  39.44 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  26.21 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  29.73 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  41.07 
 
 
301 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  41.07 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  28.45 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  41.07 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  41.07 
 
 
297 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  41.07 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36.05 
 
 
258 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  29.71 
 
 
171 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  32.99 
 
 
248 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1239  TonB-like protein  35.48 
 
 
431 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.234262  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  30 
 
 
219 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  32.26 
 
 
274 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  34.29 
 
 
284 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  28.46 
 
 
451 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  28.45 
 
 
243 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2527  TonB family protein  37.61 
 
 
390 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.700162  normal  0.957554 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>